Données d'ADN environnemental (eDNA) provenant de la Garde côtière canadienne Sir John Franklin, de la NOAA Bell M. Shimada et du R/V TINRO lors de l'expédition panpacifique hivernale en haute mer de l'Année internationale du saumon 2022
Ensemble de données de variants de séquences d'amplicons (asv) issu d'une analyse de l'ADN environnemental par métabarcodage à barres multi-amplicons lors de l'expédition Signature de l'Année internationale du saumon dans le Pacifique Nord-Est en février/mars 2022. Un tableau de tous les asv générés dans l'étude est fourni dans ASV.csv, ventilé par amplicon et échantillon et répertoriant la présence dudit asv dans ledit échantillon. De plus, le nombre total de lectures par amplicon/bac d'échantillons est enregistré ainsi qu'une attribution taxonomique. Notez que ces données sont fournies avant le filtrage. Par exemple, les lectures d' « Homo sapiens » sont abondantes et doivent être considérées comme une contamination. Les métadonnées des stations d'échantillonnage sont fournies dans le fichier sample_metadata.csv qui contient la date, lat/long, ainsi que des métadonnées environnementales détaillées associées à l'échantillon. Reportez-vous à Deeg et coll. « Les modèles spatiotemporels de l'utilisation de l'habitat hivernal du saumon dans le Pacifique Nord-Est découverts par l'ADN environnemental » ICES Journal of Marine Science 2025 (https://doi.org/10.1093/icesjms/fsaf104) pour des informations détaillées sur le prélèvement d'échantillons, le séquençage et le traitement bioinformatique.
Données et ressources
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Ensemble de données provenant de l'analyse de l'ADN environnemental par métabarcodage à barres multi-amplicons lors de l'expédition IYS High Seas de 2022ZIP Ouvrir
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Lien vers l'ensemble de données tel que publié initialement sur DryadHTML Ouvrir
Informations supplémentaires
| DOI | https://doi.org/10.5061/dryad.c2fqz61nn |
|---|---|
| Étendue temporelle | 2022-02-05 – 2022-03-20 |
| Étendue verticale | 2.0 – 3.0 m |
| Date (creation) | 2022-02-05 |
| Statut | completed |
| Fréquence de mise à jour | asNeeded |
| Langue des métadonnées | en |
| Licence | CC0 |
| Métadonnées sources | ISO 19115 XML |
| Dernière mise à jour | 2026-09-16 |
| Créé | 2026-09-16 |
| API | package_show |