ABYSS bioinformatic pipeline comparisons
The ABYSS project aims at describing deep-sea benthic biodiversity spanning several branches of the tree of life with eDNA metabarcoding tools. To accommodate both micro- and macro biologists, we designed a bioinformatic pipeline based on Illumina read correction with Dada2 allowing analysing metabarcodes from prokaryotic and eukaryotic life compartments.
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Miriam I. Brandt, Blandine Trouche, Laure Quintric, Patrick Wincker, Julie Poulain, Sophie Arnaud-Haond (2019). A flexible pipeline combining bioinformatic…HTML Ouvrir
Informations supplémentaires
| Étendue temporelle | 2015-02-01 – 2020-12-31 |
|---|---|
| Date (publication) | 2019-08-02 |
| Statut | onGoing |
| Fréquence de mise à jour | asNeeded |
| Langue des métadonnées | en |
| Licence | Donnée en accès restreint |
| Métadonnées sources | ISO 19115 XML |
| Dernière mise à jour | 2026-11-04 |
| Créé | 2026-11-04 |
| API | package_show |